De acuerdo a la Constitución del país, las dos cámaras del Parlamento eligieron a Mattarella, de 73 años, en una reunión conjunta donde participaron representantes de las 20 regiones del país.
Mattarella fue elegido nuevo presidente tras obtener 665 votos en la cuarta vuelta de las elecciones.
Así se ha convertido en el duodécimo presidente de la República con un mandato de siete años.
Según fuentes parlamentarias, Mattarella prestará su juramento el martes.
El presidente electo es candidato del gobernante Partido Democrático (PD) de Italia.
"Buen trabajo, presidente Mattarella. ¡Viva Italia!" escribió el líder del partido y primer ministro Matteo Renzi en su Twitter tras la votación.
El presidente de Rusia, Vladímir Putin, felicitó al presidente electo y expresó su confianza en un desarrollo positivo de los lazos ruso-italianos en todos los ámbitos.
Subrayó que las relaciones entre Rusia e Italia se basan en la estrecha cooperación comercial y económica.
Putin destacó la contribución de ambos países en la resolución de asuntos en la agenda internacional.