"A través de la Organización Panamericana de la Salud [OPS] se hacen las coordinaciones que sean necesarias [con Venezuela] con las directrices que ellos tengan", dijo Duque en diálogo con la emisora local La FM.
Colombia cerró las fronteras con Venezuela a las 05.00 hora local (10.0 GMT), tras declarar emergencia sanitaria.
Al respecto, Duque dijo que "desde antes de que empezaran a hacerse estos pronunciamientos" su administración había planteado el tema a la OPS.
"Ya le habíamos dicho a la OPS que nosotros estábamos dispuestos con la OPS a buscar toda la coordinación que fuera necesaria desde el punto de vista de salud para que pudiéramos entender la situación de los puntos fronterizos", señaló.
Duque aseguró que "no es confiable" tener un canal directo con Venezuela.
"Usted puede tener el canal directo que quiera, pero ese canal directo no es confiable. ¿Qué es lo que garantiza la confiabilidad? Que haya una organización, como la OPS, que es de los pocos organismos internacionales que tienen presencia en territorio venezolano, para analizar la situación de salud... esto es todo menos político", dijo Duque.
El mandatario insistió en que el diálogo con la OPS "es lo responsable" y obedece al "sentido de solidaridad con los hermanos venezolanos".
La OMS catalogó el 11 de marzo como pandemia la neumonía COVID-19, causada por el nuevo coronavirus SARS-CoV-2, que empezó a propagarse en la ciudad china de Wuhan (sudeste) a finales de 2019.
Hay más de 153.000 casos confirmados de COVID-19 y 5.735 muertes en todo el mundo, según el último informe de situación de la OMS, publicado el 15 de marzo.