"La Federación Rusa no participó en los litigios y no reconoce la decisión incompleta porque el arbitraje no tiene jurisdicción para examinar el pleito de Naftogaz y otros contra Rusia", dijo el organismo.
El Ministerio de Justicia añadió que tomará todas las medidas posibles para defender los intereses rusos en relación a la resolución judicial.
El director ejecutivo de la petrolera, Yuri Vitrenko, dijo antes que la empresa espera reclamar 8.000 millones de dólares, incluidos los intereses acumulados en el marco del caso.
En octubre de 2016 siete empresas del grupo Naftogaz iniciaron un pleito contra Rusia por una supuesta "expropriación ilegal de activos en Crimea".
También: Rusia aumenta su influencia en el mercado gasístico europeo y asiático
Según los demandantes, las pérdidas de Naftogaz por "la anexión de Crimea" y la expropriación de activos superan los 5.000 millones de dólares.
Ucrania sigue considerando a Crimea su territorio provisionalmente ocupado.
La Cancillería rusa declaró en repetidas ocasiones que los crimeos votaron democráticamente y en plena conformidad con el derecho internacional y la Carta de la ONU por la reunificación con Rusia, que respeta y acepta esta decisión.