El país hebreo desarrolla el sistema junto con EEUU para tapar las brechas de su escudo Cúpula de Hierro.
"El análisis preliminar indica que el ensayo fue un éxito", señaló el organismo en un comunicado.
Los militares aseguran que en la quinta prueba se activaron todos los componentes del sistema.
El radar detectó los blancos en el mar Mediterráneo y transmitió los datos al centro de mando, donde se diseñó el plan de respuesta y se dio la orden de interceptarlos.
"Los ingenieros analizarán la información obtenida en el ensayo para usarla en el desarrollo y el despliegue de Honda de David", subrayó el Ministerio.
En marzo pasado, el organismo anunció la entrega de los elementos esenciales del sistema a la Fuerza Aérea del país.
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Honda de David, desarrollado por las compañías israelíes Rafael, Elta y Elbit y la estadounidense Raytheon, está destinado, según aseguran los medios locales, a interceptar los misiles de Siria y el movimiento libanés Hizbulá en un rango de 70 a 300 kilómetros.