Las autoridades israelíes consideran que Irán utiliza el territorio sirio para trasladar armas al movimiento chií libanés Hizbulá.
"Los militares israelíes expusieron en Moscú su política dirigida a contener la presencia de Irán en el territorio de Siria y prevenir que suministre armas a Hizbulá", dice el comunicado.
Al mismo tiempo, los militares israelíes dijeron que el tema clave de sus conversaciones en Rusia fue la mejora del "sistema de desconflicto" en Siria.
Rusia e Israel pusieron en marcha en 2015 un mecanismo de comunicaciones llamado a prevenir enfrentamientos casuales y otros incidentes peligrosos durante operaciones en Siria.
Israel ataca periódicamente en Siria objetivos militares de Irán.
Los militares israelíes además revelaron los detalles de la operación Escudo del Norte lanzada en la frontera con el Líbano.
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La operación comenzó hace dos semanas y tiene como objetivo localizar y destruir los túneles subterráneos excavados presuntamente por Hizbulá para introducir grupos subversivos en Israel.
En el encuentro de Moscú se destacó que los militares de Rusia e Israel "llegaron a un entendimiento mutuo".
"Las delegaciones llegaron a un entendimiento mutuo y acordaron continuar la labor conjunta", señaló la oficina de prensa del Ejército de Israel.
La nota agrega que el encuentro de Moscú, coordinado en el más alto nivel, se desarrolló en un ambiente "positivo" y "profesional".
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La delegación rusa estuvo encabezada por el jefe adjunto de la Dirección General de Operaciones del Estado Mayor ruso, el general mayor Vasili Trushin, y la israelí, por el jefe de la Dirección de Operaciones del Estado Mayor israelí, general mayor Aharon Haliva.