Los otros sospechosos son el ex primer ministro Nikolái Azarov y el extitular de Finanzas Yuri Kolobov.
"En este momento tenemos la autorización para el juicio en ausencia a Yanukóvich, Azarov y Kolobov", dijo el fiscal general Yuri Lutsenko.
El proyecto debía ser realizado por la compañía Ukrtelekom privatizada en 2011.
Las manifestaciones estallaron después de que el primer ministro de entonces Nikolái Azárov anunciara la suspensión de la firma de un acuerdo de asociación con la Unión Europea.
Las nuevas autoridades ucranianas surgidas de aquellos acontecimientos responsabilizaron de la muerte de más de 100 personas a Yanukóvich y al destacamento de operaciones especiales Bérkut.
Además: Yanukóvich dispuesto a declarar en Ucrania si garantizan su seguridad
Muchos altos funcionarios se vieron obligados a abandonar el país ante las persecuciones políticas iniciadas por el nuevo régimen.