Serguéi Románov, director general interino de Energia, y Nikolái Sevastiánov, vicepresidente de Roscosmos, firmaron el documento en presencia de Dmitri Rogozin, máximo dirigente de la corporación.
Con capacidad de carga útil de 17 toneladas, el vehículo de lanzamiento constará de dos etapas.
Está previsto que se usen las tecnologías del cohete ruso-ucraniano Zenit y se empleen solo componentes rusos en la fabricación.
El primer despegue no tripulado del nuevo cohete desde el cosmódromo de Baikonur (Kazajistán) está planeado para 2022.
Rogozin confirmó que el vehículo espacial se usará solo para lanzamientos comerciales.
"No están previstas las cargas militares ya que los lanzamientos se realizarán desde Baikonur", subrayó.
Según los planes, el Soyuz 5 llevará tripulantes a la Estación Espacial Internacional en 2024.
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El director general de Roscosmos indicó también que el propulsor más potente del mundo RD-171 será sometido a una profunda modernización.
"El propulsor RD-171 para el nuevo cohete Soyuz 5 será modernizado para otorgarle características únicas", puntualizó.
La modernización del motor requiere una inversión de unos 100 millones de dólares.