Anteriormente se recomendaba evacuar a 21.000 personas.
En una hora en la prefectura cayeron más de 100 litros por metro cuadrado lo que ha disparado las alertas por posibles inundaciones y deslizamientos de tierra.
Hace dos semanas las fuertes precipitaciones causaron desbordamientos en ríos y aludes en el suroeste del país provocando 34 muertes, diez personas permanecen desaparecidas.
También se esperan intensas lluvias en la prefectura de Fukushima.
Lea más: Más de 610 hospitalizados por el calor en Japón en un día
Los meteorólogos llaman a los habitantes de las dos prefecturas a alejarse de las laderas de los montes y precipicios y no acercarse a las orillas de los ríos.