El balance corresponde a las 13:30 hora local (GMT+9). Las operaciones de rescate a lo largo del archipiélago siguen en curso, por lo que las cifras podrían revisarse al alza en las próximas horas.
Previamente se informó de al menos 14 víctimas mortales, más de 120 heridos y 16 desaparecidos.
El nivel máximo de alerta, declarado el 12 de octubre, ya se levantó en todas las regiones del país.
El tifón Hagibis golpeó la isla de Honshu, la principal del archipiélago japonés, con vientos de hasta 162 km/h y ráfagas de hasta 234 km/h, fuerza suficiente para volcar un camión o llevarse el tejado de una casa y el tendido eléctrico.
El secretario general del Gobierno japonés, Yoshihide Suga, informó en una rueda de prensa que el desastre provocó apagones en más de 376.000 casas.
En la ciudad de Nagano unas 160 personas quedaron atrapadas dentro del edificio de una residencia de ancianos por las inundaciones.
Mientras en la prefectura de Saitama el agua bloqueó la salida a 260 ancianos.
La evacuación de esas personas está en curso.