Se señala que primero se reportó una avería provocada por el ingreso de agua de mar al sistema de ventilación, que causó un incendio en el tanque de baterías número 3.
El informe destaca la gravedad de los incendios de ese tipo y señala que este siniestro mostró una "crisis organizacional".
"El incendio en los tanques de baterías de los submarinos son accidentes muy graves, son sumamente difíciles de extinguir y obligan en todos los casos que el submarino se mantenga en la superficie. Esta avería fue subestimada por toda la cadena de comando", indica.
Además, se apunta a un "inadecuado manejo" de la emergencia durante las horas críticas desde las bases operativas en tierra.
"Resulta entonces necesario un serio replanteo del sistema de defensa en pos de incrementar la actividad operativa", subraya el texto.
El informe alerta que la cantidad y la calidad del personal de la Armada argentina sufre un "paulatino deterioro" y el personal más calificado opta por la actividad privada y las fuerzas de seguridad.
El San Juan, en el que navegaban 44 tripulantes, estuvo desaparecido durante un año hasta que fue localizado en noviembre de 2018 en el Mar Argentino a 907 metros de profundidad, tras una búsqueda que realizó la empresa estadounidense Ocean Infinity.