El atacante, supuestamente un estudiante universitario, agredió por motivos desconocidos a un grupo de feligreses a la entrada de la iglesia de Santa Lidwina en el distrito de Sleman, después de lo cual irrumpió dentro, corrió hacia el coro para atacar al pastor y cortó las estatuas de Jesucristo y la vírgen María.
Según algunos testigos, el hombre llevaba una espada de un metro de largo.
En el ataque resultaron heridos dos feligreses, el pastor Edmund Prier que dirigía el coro y un oficial de policía.
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Los agentes que llegaron a la escena realizaron un tiro de advertencia, que fue ignorado, tras lo cual dispararon en el estómago del agresor y le trasladaron a un hospital.