"Mi tarea es mantener la reputación de la FIFA y encontrar una salida a la situación", dijo Blatter en Zúrich, donde se inauguró el 65º Congreso de la FIFA.
"Es nuestra tarea en la FIFA y cooperaremos con las autoridades para convencernos de que todos han sido capturados y sancionados", declaró Blatter al subrayar que no debe haber corrupción de ningún tipo.
En su opinión, han llegado unos tiempos "sin precedentes y muy difíciles" para la entidad.
"Las acciones de algunos traen vergüenza y humillación al fútbol, y requieren el cambio de algunos de nosotros", indicó el presidente de la FIFA.
Al comentar el escandalo el periodista británico Andrew Jennings declaró que el objetivo de la investigación es Blatter.
"Habrá más por venir, Blatter es el objetivo", escribió el periodista en su cuenta de Twitter.
I gave the FBI the crucial documents that triggered yesterday's arrests. There will be more to come. Blatter is a target.
— Andrew Jennings (@AAndrewJennings) May 28, 2015
"Yo di al FBI los documentos clave que llevaron a los arrestos de ayer", escribió.
Jennings, quien acusó en 2002 a Blatter de corrupción, es un conocido periodista de investigación y autor de varios libros sobre la corrupción en la FIFA.
La víspera, el Departamento de Justicia de EEUU solicitó el procesamiento de 14 directivos de la FIFA a los que acusa de extorsión, fraude y lavado de dinero.