"Es la primera vez que los refugiados llegan a Estonia a través de Turquía", dice el comunicado.
Antes el país recibía a los refugiados que llegaban desde Grecia.
El informe revela que se trata de dos familias de refugiados, una de cinco personas, y otra de seis.
El primer ministro de Estonia, Taavi Roivas, durante la entrevista en el marco de la cumbre de la OTAN en Varsovia en julio con el presidente de Turquía, Recep Tayyip Erdogan, señaló el importante aporte de Turquía para solucionar la crisis migratoria.
Europa se enfrenta a la mayor crisis migratoria desde la Segunda Guerra Mundial, provocada ante todo por una serie de conflictos armados y problemas económicos en los países del Oriente Próximo y África del Norte.
En septiembre de 2015 el presidente de la Comisión Europea, Jean Claude Juncker, propuso a los estados miembros la reubicación obligatoria de 120.000 refugiados en dos años.
Según el plan de la Comisión Europea para el reparto de refugiados, Estonia debe recibir alrededor de 550 personas.