El medio precisa que dos personas fallecieron bajo los escombros de edificios y una a causa de un incendio provocado por el desastre.
Anteriormente se informó que el sismo destruyó 20 edificios y que unas 200 personas fueron hospitalizadas.
En la búsqueda de las víctimas participan cerca de 390 militares.
El terremoto de magnitud 6,4 se produjo en la tarde de este jueves, el epicentro de las sacudidas se ubicó en la ciudad Kumamoto.
La Agencia Meteorológica de Japón asignó la magnitud 7 al temblor, la máxima según la escala japonesa.